自1984年起，以促進醫(yī)學(xué)學(xué)科發(fā)展為目的，原衛(wèi)生部啟動重點實驗室（含工程技術(shù)中心）建設(shè)，實驗室主要布局在原衛(wèi)生部直屬醫(yī)學(xué)院校，兼顧了部分地方醫(yī)學(xué)高校和醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)，至2013年，共建設(shè)重點實驗室81家。為加強計劃生育科研能力和計生技術(shù)監(jiān)測工作，原國家人口計生委在部分地區(qū)建設(shè)重點實驗室，共建成12家（其中2013年集中建設(shè)10家，由國家發(fā)展改革委投入建設(shè)經(jīng)費）。2013年兩部門整合組建國家衛(wèi)生計生委后，未新增建設(shè)。經(jīng)過“十二五”評估和原國家計生委建設(shè)重點實驗室驗收后，共有國家衛(wèi)生健康委重點實驗室88個。
為貫徹落實習(xí)近平總書記“抓住機遇、迎難而上，努力把中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院建設(shè)成為我國醫(yī)學(xué)科技創(chuàng)新體系的核心基地”的重要指示精神，國家衛(wèi)生健康委于2018年4月將委重點實驗室的日常管理工作委托給中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院，以進一步探索“管辦分開，政事分離”，推動科技體制改革，強化委重點實驗室規(guī)范管理。
在國家衛(wèi)生健康委指導(dǎo)和支持下，中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院積極開展委重點實驗室“十三五”運行情況的評估、中西部地區(qū)委省共建重點實驗室的新增建設(shè)及現(xiàn)場驗收、委重點實驗室的建設(shè)布局規(guī)劃編制等工作：2019年至2021年，協(xié)助國家衛(wèi)生健康委面向中西部地區(qū)和新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團新增建設(shè)委重點實驗室1個和委省共建重點實驗室20個，并陸續(xù)開展建設(shè)驗收；完成委重點實驗室“十三五”運行情況評估，推動委重點實驗室的優(yōu)勝劣汰、動態(tài)調(diào)整；探索建立委重點實驗室的支持機制，為“十二五”“十三五”評估優(yōu)秀委重點實驗室和中西部地區(qū)新增建設(shè)委省共建重點實驗室提供經(jīng)費支持。
截至2024年12月，全國共有國家衛(wèi)生健康委重點實驗室102個（含委省共建重點實驗室22個）。
國家衛(wèi)生健康委重點實驗室作為我國衛(wèi)生健康科技創(chuàng)新體系的重要組成部分，認真貫徹實施創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展戰(zhàn)略，以人民健康為中心，聚焦行業(yè)重大需求，在轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)與臨床醫(yī)學(xué)研究、藥物與器械研發(fā)、疾病防治技術(shù)與策略、衛(wèi)生政策與管理等方面積極開展創(chuàng)新研究，取得一系列成果并應(yīng)用于實踐，為解決行業(yè)關(guān)鍵科學(xué)和技術(shù)問題、促進科技進步、支撐健康中國建設(shè)發(fā)揮了重要作用。
