皮膚病研究所真菌科劉維達教授團隊基于基因組特點的種系進化進行分析揭示了紫色毛癬菌(T.violaceum)與紅色毛癬菌(T.rubrum)臨床致病差異,相關(guān)研究結(jié)果以題為“Phylogeny of dermatophytes with genomic character evaluation of clinically distinct Tricho- phyton rubrum and T. violaceum”的研究論文于2018年2月在線發(fā)表于著名真菌研究雜志Studies in Mycology(影響因子14.00)。
紅色毛癬菌和紫色毛癬菌是引起皮膚感染的兩大主要真菌。臨床發(fā)現(xiàn),紅色毛癬菌主要感染皮膚和甲,而紫色毛癬菌更易感染頭皮和毛發(fā)。兩者的系統(tǒng)進化特點極為相似,但表型差異較大。闡明紅色毛癬菌與紫色毛癬菌的致病差異機理是醫(yī)學真菌研究的重要問題,具有重大理論及潛在臨床應用價值,然而,迄今為止這是一個未解之謎。
在本研究中,劉維達團隊占萍博士對紅色毛癬菌與紫色毛癬菌進行全基因組測序,并與數(shù)據(jù)庫的皮膚癬菌測序數(shù)據(jù)進行比照,同時對粘附素與分泌型蛋白酶等致病因子進行預測以及進化分析。結(jié)果顯示,親土皮膚癬菌的種間進化差異較顯著,親人和親動物皮膚癬菌種間進化差異較??;紅色毛癬菌與紫色毛癬菌基因序列相似度達99.38 %,紫色毛癬菌較紅色毛癬菌有更多旁系等位基因。預測發(fā)現(xiàn),皮膚癬菌存在30個粘附因子相關(guān)基因,紅色毛癬菌和紫色毛癬菌存在17個粘附因子基因,紅色毛癬菌存在4個特異粘附因子基因,紫色毛癬菌存在8個特異粘附因子基因。多基因位點系統(tǒng)計劃分析和基因組對比來看,紅色毛癬菌與紫色毛癬菌具有高度的親緣關(guān)系。最后文章指出,紅色毛癬菌與紫色毛癬菌可能是同一種菌,其表型的差異可能是由于在不同體表位置而表現(xiàn)不同。這是一種嶄新的發(fā)現(xiàn),對紅色毛癬菌與紫色毛癬菌的認識和研究引入新境界,具有重要的理論指導意義。
劉維達教授團隊占萍博士(第一作者)目前工作于江西省皮膚病專科醫(yī)院。阿姆斯特丹大學生物多樣性和生態(tài)系統(tǒng)動力學研究所G.S.de Hoog教授合作參與了該項研究。該研究獲得中國醫(yī)學科學院醫(yī)學與健康科技創(chuàng)新工程(2016-I2M-3-021)、國家自然科學基金委的資助(31600120)及科技部基礎性工作專項(2013FY113700)支持。
論文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166061618300071
(皮膚病醫(yī)院)