1890年，劉瑞恒生于天津市。10歲時被送進(jìn)英國人在當(dāng)?shù)貏?chuàng)辦的“新學(xué)書院”。1903年入天津北洋大學(xué)。1906年，直隸總督袁世凱下令選派一批青年到美國留學(xué)。經(jīng)學(xué)校保送，他獲得了公費留學(xué)美國的資格，入哈佛大學(xué)讀書。1909年他獲得理學(xué)學(xué)士學(xué)位，因?qū)︶t(yī)學(xué)發(fā)生了濃厚的興趣而決定入哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院學(xué)醫(yī)，專攻外科。1913年，他獲得醫(yī)學(xué)博士學(xué)位。1913－1915年，在美國波士頓市立醫(yī)院任實習(xí)醫(yī)師。1915年，劉瑞恒回國，先在上海紅十字會和中國哈佛醫(yī)學(xué)院工作。1918年，經(jīng)由伍連德推薦，他來到北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院任外科醫(yī)師。
1924－1926年，劉瑞恒任北京協(xié)和醫(yī)院代理院長，成為協(xié)和醫(yī)院首位中國人院長。1926年，劉瑞恒升任協(xié)和醫(yī)院院長。1926－1928年，劉瑞恒被選為中華醫(yī)學(xué)會理事長。1928年，劉瑞恒被南京國民政府任命為衛(wèi)生部次長，主持常務(wù)工作。1929年，他兼任北平協(xié)和醫(yī)學(xué)院校長，成為協(xié)和首位中國人校長。1929年至1930年，劉瑞恒代理衛(wèi)生部部長。1931年南京國民政府將衛(wèi)生部縮編為內(nèi)政部衛(wèi)生署，劉瑞恒改任衛(wèi)生署署長，直至抗戰(zhàn)，同時兼任中央禁煙委員會主任委員和軍醫(yī)署署長。
1937年，國民政府任命劉瑞恒為后方軍事委員會衛(wèi)生勤務(wù)部部長，負(fù)責(zé)管理軍醫(yī)業(yè)務(wù)。當(dāng)時后方急需藥品，他受政府派遣，于1939年在香港組建協(xié)和藥品有限公司，并擔(dān)任總經(jīng)理，主持制造各種西藥運(yùn)往后方。太平洋戰(zhàn)爭爆發(fā)后，香港很快淪陷，劉瑞恒又轉(zhuǎn)道至美國華盛頓，在1942－1945年間，任中國駐美國華盛頓物資采購團(tuán)代表，設(shè)法為后方獲得了美國方面提供的價值六、七千萬美元的醫(yī)藥物資。
抗戰(zhàn)勝利后，劉瑞恒于1946年任美國醫(yī)藥援華會主任，兼任國民政府行政院善后救濟(jì)總署衛(wèi)生委員會主任，辦理戰(zhàn)后全國各地衛(wèi)生機(jī)構(gòu)、醫(yī)院和醫(yī)學(xué)校等方面的恢復(fù)工作。在他幫助之下，衛(wèi)生部防癆委員會相繼在北平、天津、南京、上海、廣州、重慶、青島、臺灣等地建立起了結(jié)核病防治中心。
1949年后，劉瑞恒到了臺灣，主持“臺灣地區(qū)醫(yī)療衛(wèi)生委員會”，擔(dān)任當(dāng)?shù)丶t十字會長、防癆協(xié)會常務(wù)理事、臺灣省血清疫苗制造所審議委員會和環(huán)境衛(wèi)生指導(dǎo)委員會主任委員。在臺灣，劉瑞恒繼續(xù)開展工作，把發(fā)展醫(yī)學(xué)與促進(jìn)公共衛(wèi)生工作相互配合，成果卓著。他又爭得美國醫(yī)學(xué)界的支持，資助本地醫(yī)學(xué)教育機(jī)構(gòu)和公共衛(wèi)生工作人員赴美深造。1961年8月，劉瑞恒病逝于美國紐約。
